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PCR Cabinet Was macht UV Licht mit der DNA

Frage: PCR Cabinet Was macht UV Licht mit der DNA
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Ich habe ein Schülerpraktikum in einem Labor gemacht (Max Plank Institut).
Dort wurde die PCR (Polymerase Ketten Reaktion) immer in einer kleinen Kabine mit eingebautem UV Licht einem sog. UV Cabinet durchgeführt. Bevor die PCR Reaktionen angesetzt wurden wurde immer für 20 Minuten das UV Licht angeschaltet um die um die Proben nicht mit DNA von anderen Proben zu verunreinigen. Aber was macht das UV Licht eigentlich? Die DNA kann doch durch die UV Bestrahlung in dem UV Cabinet nicht einfach verschwinden.
Frage von Heli61 | am 27.09.2019 - 19:09


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Antwort von cleosulz | 27.09.2019 - 19:37
Diese Frage solltest du in deinem Praktikumsbetrieb fragen.

Ich habe mal bemüht: www.laborjournal.de
Desinfektion des Arbeitsplatzes?
www.biostep.de
biosan.lv
Zitat:
Die UV-Strahlung der offenen Lampen desinfiziert den Arbeitsbereich, indem die DNA-/RNA-Fragmente während der 15- bis 30-minütigen Exposition deaktiviert werden. Ein digitaler Timer steuert die Dauer der direkten UV-Strahlung. Eine Tageslichtlampe bietet angemessene Beleuchtung der Arbeitsfläche.
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Nur an absolut sauberen Arbeitsplätzen kann diese Arbeit zuverlässig gelingen, deshalb werden die PCR-Arbeitsplätze auch öfters mit UVC-Licht bestrahlt, das jede Fremd-DNA zerstört.
=> Facharbeit, Seite 21
https://www.emilfischerschule.de/images/dokumente/fachschule/technikerarbeiten/2009/2009_bt_technikerarbeit-eckl.pdf

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Antwort von cleosulz | 27.09.2019 - 20:03
www.lenntech.de
Zitat:
Die UV-Strahlen erzeugen in den Nukleinsäuren der DNA Resonanzen und brechen die Bindungen der Moleküle auf. Der Zellkern der Mikroorganismen wird so verändert, dass eine Zellteilung unmöglich wird.
Zitat:
Photonen zerstören direkt die Bindungen innerhalb der DNA Stränge von Viren, Bakterien und Schimmelsporen. Dadurch wird eine Vermehrung unterbrochen.
Bild dazu => www.heraeus.com


Hilft dir das weiter?
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Antwort von ricarda1001 | 27.09.2019 - 21:05
Die DNA wird duch das kurzwellige UV Licht natürlich nicht entfernt. Die UV Strahlung verknüpft benachbarte Pyrimidine (also Cytosin oder Thymin) in der DNA kovalent. Die Taq DNA Polymerase kann den Gegenstrang an dieser Stelle nicht verlängern. Die DNA kann also nicht vervielfältigt werden und stört so nochfolgende PCR Reaktionen nicht. Hier steht das auch nochmal in Bezug auf ein PCR Cabinet: "..UV tube disinfects and effectively inactivates nucleic acids by causing pyrimidine dimers that block subsequent PCR amplification...."
https://simplebiotech.de/produkt/uv-pcr-workbench/
Ich hoffe ich konnte dir damit weiterhelfen.


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Antwort von fabian1110 | 29.09.2019 - 04:47
Das UV-Licht im Cabinet dient der Entkeimung des Cabinets, um eine Kontamination der PCR-Reaktion zu verhindern, denn die PCR-Reaktion ist sehr sensitiv und würde DNA von Bakterien mit amplifizieren. Die hier relevante Entkeimungswirkung beruht auf der Zerstörung der Desoxyribonukleinsäure (DNA) der Bakterien. Die Entkei­mungseffizienz hängt direkt vom Absorp­tionsspektrum der DNA, welches ein Maximum bei ca. 265 nm hat, ab. Bei einer Anwendung einer UV-C Lichtquelle mit einem Spektralbereich von 265 nm, wirkt die UV-Strahlung direkt auf die DNA ein und die DNAStränge werden aufgebrochen und setzen sich zu neuen Verbindungen zusammen. Hierdurch wird die Reproduktionsfähigkeit der Bakterien gehemmt.

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